Si è presenti difronte ad un caso di celiachia "latente" quando, le anali del sangue del soggetto rilevano la presenza di anticorpi antiendomisio e antigladina, ma la gastroscopia non rileva un sostanziale appiattimento dei villi, causa di buona parte dei sintomi che inducono ad indagare la diagnosi di celiachia. Quando si è in presenza di una "Celiachia Lantente", proprio perchè non si rilevano i normali sintomi dovuti a problemi intestinali derivati dal malassorbimento causato dal danneggiemento della mucosa, risulta di ancora più difficile diagnosi. Le analisi del sangue possono comunque accertare la diagnosi e dare inizio alla profilassi.